Метронидазол является производным нитроимидазола и оказывает антибактериальное и антипротозойное действие. Он эффективен по отношению к анаэробным бактериям, в том числе Gardnerella vaginalis и простейшим Trichomonas vaginalis, Giardia lamblia и Entamoeba histolytica. При этом он не влияет на физиологическую бактериальную флору влагалища.