Руксолитин является селективным ингибитором янус-киназ (JAK) JAK1 и JAK2 (значения IC50 для ферментов JAK1 и JAK2 соответственно составляют 3,3 нмоль и 2,8 нмоль). Эти ферменты являются посредниками в передаче сигналов ряда цитокинов и факторов роста, которые важны для кроветворения и иммунной системы.