У пациентов с ревматоидным артритом лечение тофацитинибом в течение периода до 6 месяцев было ассоциировано с дозозависимым снижением количества циркулирующих клеток природных киллеров, положительных по рецепторам CD16/56+, причем, по оценкам, максимальное снижение количества этих клеток происходило примерно через 8–10 недель после начала. Эти изменения обычно исчезали в течение 2-6 недель после прекращения терапии. Терапия тофацитиниба была ассоциирована с дозозависимым увеличением количества B-клеток. Изменения в количестве циркулирующих Т-лимфоцитов и подгрупп Т-лимфоцитов (CD3+, CD4+ и CD8+) были незначительными и непостоянными.